Το Γενικό Νοσοκομείο – Κέντρο Υγείας Καλύμνου «Το Βουβάλειο» αποτελεί αυτοτελές Νομικό Πρόσωπο Δημοσίου Δικαίου, το οποίο υπάγεται στην 2η Υγειονομική Περιφέρεια Πειραιώς και Αιγαίου. Το ίδρυμα λειτουργεί συνδυαστικά ως Νομαρχιακό Γενικό Νοσοκομείο και ως Κέντρο Υγείας, με τη συνολική του δυναμικότητα να ορίζεται στις εξήντα πέντε οργανικές κλίνες. Η δομή της ιατρικής του υπηρεσίας είναι διαρθρωμένη σαφώς σε Παθολογικό, Χειρουργικό και Εργαστηριακό Τομέα, ενσωματώνοντας παράλληλα εξειδικευμένες δομές, όπως τη Μονάδα Τεχνητού Νεφρού, τη Μονάδα Εμφραγμάτων και τον Υπερβαρικό Θάλαμο. Την ανώτατη διοικητική και εποπτική αρμοδιότητα για την οργάνωση και τη λειτουργία του οργανισμού ασκεί το Διοικητικό Συμβούλιο, με Πρόεδρο και Διοικητή του Νοσοκομείου τον κύριο Κόγκα Τυπάδη – Παντελεήμων.